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NC膜、PVDF膜、尼龍膜的應(yīng)用及差別
硝酸纖維素膜(nitrocellulose filter membrane,簡稱NC膜),NC膜在Northern Blot、Southern Blot、Western Blot中都需要用到,雜交技術(shù)有固相雜交和液相雜交之分。固相雜交技術(shù)目前較為常用,先將待測核酸結(jié)合到一定的固相支持物上,再與液相中的標(biāo)記探針進(jìn)行雜交。固相支持物常用硝酸纖維素膜。
PVDF膜即聚偏二氟乙烯膜(polyvinylidene fluoride)是蛋白質(zhì)印跡法中常用的一種固相支持物。PVDF膜是疏水性的,膜孔徑有大有小,隨著膜孔徑的不斷減小,膜對低分子量的蛋白結(jié)合就越牢固。大于20000的蛋白選用0.45um的膜,小于20000的蛋白選用0.2um的膜。PVDF膜使用是需預(yù)處理,用甲醇處理的目的是活化膜上的正電基團(tuán),使其更容易與帶負(fù)電的蛋白結(jié)合。PVDF膜具有較高的機(jī)械強(qiáng)度,是印跡法中的理想固相支持物材料。
尼龍膜是一種合成的長鏈聚酰胺薄膜,對核酸和蛋白質(zhì)具有很強(qiáng)的結(jié)合能力,能代替硝酸纖維素薄膜用于分子印跡和雜交實(shí)驗(yàn)。
NC膜、PVDF膜、尼龍膜的差別:尼龍膜是較理想的核酸固相支持物,有多種類型;硝酸纖維素膜是目前應(yīng)用zui廣的一種固相支持物,價(jià)格*;PVDF膜介于二者之間。
1.就結(jié)合能力而言:尼龍膜結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)480-600μg/cm2,可結(jié)合短至10bp的核酸片段;硝酸纖維素膜結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)80-100μg/cm2,對于200bp的核酸片段結(jié)合能力不強(qiáng);PVDF膜結(jié)合DNA和RNA能力可達(dá)125-300μg/cm2。
2.就溫度適應(yīng)性而言:尼龍膜經(jīng)烘烤或紫外線照射后,核酸中的部分嘧啶堿基可與膜上的正電荷結(jié)合;硝酸纖維素膜依靠疏水性相互作用結(jié)合DNA,結(jié)合不牢固;PVDF膜結(jié)合牢固,耐高溫,特別適合于蛋白印跡。
就韌性而言:尼龍膜較強(qiáng);硝酸纖維素膜較脆,易破碎;PVDF膜較強(qiáng)。
3.就重復(fù)性而言:⑴、尼龍膜可反復(fù)用于分子雜交,雜交后,探針分子可經(jīng)堿變性被洗脫下來;硝酸纖維素膜不能重復(fù)使用;PVDF膜可以重復(fù)使用。
⑵、NC膜的使用也很簡便,比如不需要甲醛預(yù)處理,只要在無離子水面浸潤排出膜內(nèi)氣泡,再在電泳緩沖液中平衡幾分鐘就可以了;比如NC膜很容易封閉,也不需要特別嚴(yán)謹(jǐn)?shù)那逑礂l件。轉(zhuǎn)移到NC膜上的蛋白在合適的條件下可以穩(wěn)定保存很長時間,不過要注意的是純的硝纖膜在比較脆,又容易卷,操作要小心,不適合用于需要多次重復(fù)清洗的用途。因?yàn)榻?jīng)不起多次“折磨”。選擇硝纖膜時要注意的是選擇合適的孔徑,通常20KD以上的大分子蛋白用0.45um孔徑的膜,小于20KD的話建議選擇0.2um的,如果小于7KD的話選擇0.1um的膜。另外還要注意選擇純的NC膜混有含醋酸纖維(CM)的NC膜結(jié)合力會有所降低。
⑶、由于NC膜上結(jié)合的蛋白會因?yàn)橐恍┤ノ蹌┒淮?,因此在封閉時使用較溫和的Tween20,而且濃度不要超過0.3%(據(jù)說0.05%效果)。一般而言,NC膜越純,其蛋白結(jié)合能力就越高,所以要增加WB的靈敏度和分辨率,提高所使用膜的純度是個可以考慮的選擇。如果NC膜攙雜一些醋化纖維素這在前面已經(jīng)提到,會影響蛋白質(zhì)結(jié)合
⑷、與硝酸纖維素膜相比,PVDF膜在蛋白質(zhì)截留能力,機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)相容性上都更*的性能。市售硝酸纖維素膜的典型結(jié)合量是80-100μg/cm2,而PVDF膜結(jié)合量是100-200μg/cm2(而結(jié)合強(qiáng)度PVDF比硝纖膜強(qiáng)6倍!)。但是PVDF膜zui大的優(yōu)點(diǎn)不僅于此:更好的機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)耐受性使PVDF膜在各種染色應(yīng)用和多重免疫檢測中成為理想選擇;而且單個凝膠的泳道復(fù)本可用于多種目的,特別是需要做N端蛋白測序,在相當(dāng)“嚴(yán)酷”的清洗條件下,當(dāng)尼龍或者硝纖膜已經(jīng)降解的情況下PVDF膜依然保持本色,所以PVDF也是要做蛋白測序的*選擇。但不適合熒光。PVDF膜特別注意的是需要100%甲醇預(yù)處理(不超過15秒)再用緩沖液平衡,才能用。